RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587563.5

RPRD1A-205, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, human

TSL 3

Gene RPRD1A, Length 643 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPRD1A-205	ENST00000587563	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	FAM3C	Q92520	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	RUBCN	Q92622	972 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	UBE4B	O95155	1302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563		H7C4K7	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	CYB561D2	O14569	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	PSMA7	O14818	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	ZNF263	O14978	683 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	RAP2A	P10114	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	PSMC3	P17980	439 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	LMO2	P25791	158 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	CYP2J2	P51589	502 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	STX17	P56962	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	SESN3	P58005	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	ZXDB	P98169	803 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	STIM1	Q13586	685 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	HPS4	Q9NQG7	708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	MYH11	P35749	1972 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	SYCE3	A1L190	88 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	LINC00473	A8K010	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPRD1A-205	ENST00000587563	PPP6C	O00743	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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