RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRSS38A1L453 326 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GLB1P16278 677 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RHDQ02161 417 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 VAC14Q08AM6 782 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRAF2Q12933 501 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CERCAMQ5T4B2 595 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HGSNATQ68CP4 663 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OGFOD3Q6PK18 319 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PCSK4Q6UW60 755 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SFTPA2Q8IWL1 248 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCL4L1Q8NHW4 92 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TEKT4Q8WW24 435 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM74Q96NL1 305 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WDR70Q9NW82 654 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ANAPC7Q9UJX3 599 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NOBOXO60393 691 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MMP13P45452 471 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CDH6P55285 790 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KRT81Q14533 505 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C14orf28Q4W4Y0 310 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MARC1Q5VT66 337 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HEATR4Q86WZ0 1026 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IP6K2Q9UHH9 426 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 APPL1Q9UKG1 709 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PHTF1Q9UMS5 762 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RNF215Q9Y6U7 377 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GOLGA6CA6NDK9 693 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GOLGA6BA6NDN3 693 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GOLGA6DP0CG33 693 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UGT1A5P35504 534 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ETV3P41162 512 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SSR1P43307 286 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TPM4P67936 248 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARHGEF7Q14155 803 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 JAMLQ86YT9 394 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NIPA2Q8N8Q9 360 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DTD2Q96FN9 168 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FUCA2Q9BTY2 467 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NUP85Q9BW27 656 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KCTD5Q9NXV2 234 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LRIT1Q9P2V4 623 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 A0A1W2PQJ5 194 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HGFP14210 728 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LHCGRP22888 699 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCKBRP32239 447 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FANCCQ00597 558 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CLN3Q13286 438 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIAA1524Q8TCG1 905 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SSUH2Q9Y2M2 353 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CFAP46Q8IYW2 2715 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PGLSO95336 258 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SERPING1P05155 500 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 JMJD7P0C870 316 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PNLIPP16233 465 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CFHR1Q03591 330 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NFKBIBQ15653 356 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RALGPS1Q5JS13 557 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARMC12Q5T9G4 340 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RAET1GQ6H3X3 334 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP45Q70EL2 814 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPRED1Q7Z699 444 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF843Q8N446 348 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CPLX3Q8WVH0 158 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TEX101Q9BY14 249 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NT5MQ9NPB1 228 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AGRPO00253 132 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCNB1P14635 433 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CTPS1P17812 591 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC5A2P31639 672 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MMRN1Q13201 1228 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PTPRRQ15256 657 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC81Q6ZN84 652 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 Q6ZVL8 140 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LUZP1Q86V48 1076 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SCRN2Q96FV2 425 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GSDMCQ9BYG8 508 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CBX8Q9HC52 389 aa28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms