RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574166.1

CLUH-208, Transcript of clustered mitochondria homolog, humanhuman

TSL 4

Gene CLUH, Length 585 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUH-208ENST00000574166 IFT43Q96FT9 208 aa14.66□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 APOOQ9BUR5 198 aa14.66□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.66□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 UBP1Q9NZI7 540 aa14.66□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.66□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 SCN8AQ9UQD0 1980 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 F5H423 210 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 KCNN4O15554 427 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 PMPCBO75439 489 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 PIAS2O75928 621 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 CSF2P04141 144 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 C1SP09871 688 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 ZNF30P17039 623 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 PTSQ03393 145 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 CDK18Q07002 472 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 INAVAQ3KP66 663 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 Q6ZVL8 140 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 TRIM58Q8NG06 486 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 DTD2Q96FN9 168 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 FCRL5Q96RD9 977 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 TRIB3Q96RU7 358 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 LYSMD1Q96S90 227 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 FERMT1Q9BQL6 677 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 KLF15Q9UIH9 416 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 OR1A2Q9Y585 309 aa14.65□□□□□ -0.06
CLUH-208ENST00000574166 H3BM21 787 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 CLDN7O95471 211 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 DGKAP23743 735 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 NFATC4Q14934 902 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 PNCKQ6P2M8 343 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 MACC1Q6ZN28 852 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 PELI3Q8N2H9 469 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 SLC25A45Q8N413 288 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 EID2Q8N6I1 236 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 CDC6Q99741 560 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 USP29Q9HBJ7 922 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 CD84Q9UIB8 345 aa14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 GOLGA6BA6NDN3 693 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 K7ESM1 405 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 NDST3O95803 873 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 ADRB1P08588 477 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 JUNDP17535 347 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 HTR1BP28222 390 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 STC1P52823 247 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 WNT3AP56704 352 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 MPP3Q13368 585 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 CDKN3Q16667 212 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 KDELC1Q6UW63 502 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 GBA3Q9H227 469 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 CARD9Q9H257 536 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 PTPRBP23467 1997 aa14.62□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa14.62□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 PIRTP0C851 137 aa14.62□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 TSHRP16473 764 aa14.62□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 TRIM23P36406 574 aa14.62□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 KIAA1024LP59773 190 aa14.62□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 FOXK2Q01167 660 aa14.62□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 PPARDQ03181 441 aa14.62□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 DPTQ07507 201 aa14.62□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 GSE1Q14687 1217 aa14.62□□□□□ -0.07
CLUH-208ENST00000574166 FAXCQ5TGI0 409 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms