RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	SPATA31D3	P0C874	917 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TNNI1	P19237	187 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	PRKCI	P41743	596 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	GCLM	P48507	274 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	MFAP3	P55082	362 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TAP2	Q03519	686 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ASIC2	Q16515	512 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TTC39C	Q8N584	583 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM168A	Q92567	244 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CCDC42	Q96M95	316 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	CDT1	Q9H211	546 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	DEF6	Q9H4E7	631 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	RAB20	Q9NX57	234 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	HSF4	Q9ULV5	492 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	C2CD2	Q9Y426	696 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNOT1-222	ENST00000570139	ANK1	P16157	1881 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139		F8VZ95	297 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	NDUFA10	O95299	355 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	LCA5L	O95447	670 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	SGPL1	O95470	568 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CER1	O95813	267 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	VDR	P11473	427 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	P4HA1	P13674	534 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	HGF	P14210	728 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	EPHA3	P29320	983 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ARL3	P36405	182 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PIK3CA	P42336	1068 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ACOT2	P49753	483 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	KLK7	P49862	253 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	GATM	P50440	423 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PDCL	Q13371	301 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ITGA7	Q13683	1181 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CLCA4	Q14CN2	919 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	SEC23B	Q15437	767 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	SPA17	Q15506	151 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	LCE1D	Q5T752	114 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	LMO3	Q8TAP4	145 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CAGE1	Q8TC20	777 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	APOPT1	Q96IL0	206 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	FUZ	Q9BT04	418 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	SIX2	Q9NPC8	291 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	SUFU	Q9UMX1	484 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	TSPAN4	O14817	238 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	EPHB6	O15197	1021 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	B4GALT5	O43286	388 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	KRT86	O43790	486 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	F9	P00740	461 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	EDN1	P05305	212 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	IQCF3	P0C7M6	154 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	STAG3L1	P0CL83	205 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	TNNT1	P13805	278 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	GALNS	P34059	522 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CHN2	P52757	468 aa		7.32	□□□□□ -1.24

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