RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 GSC2O15499 205 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TULP3O75386 442 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 STBD1O95210 358 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 LRPAP1P30533 357 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CASP5P51878 434 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ITGA9Q13797 1035 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TTMPQ5BVD1 217 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 OR2L8Q8NGY9 312 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 FAM151AQ8WW52 585 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CYP3A43Q9HB55 503 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 NYAP2Q9P242 653 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 PXDNQ92626 1479 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 FOXO6A8MYZ6 492 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 RARGP13631 454 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 RPS12P25398 132 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CD52P31358 61 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 UQCRC1P31930 480 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 OAFQ86UD1 273 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SELENOMQ8WWX9 145 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ART5Q96L15 291 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MEGF6O75095 1541 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 GAKO14976 1311 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CACNA1FO60840 1977 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 WASH3PC4AMC7 463 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 GLRA3O75311 464 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MAN2A2P49641 1150 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ENTPD1P49961 510 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 HSF2Q03933 536 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MAP2K5Q13163 448 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 AIF1LQ9BQI0 150 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.46□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 COL6A1P12109 1028 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 FDFT1P37268 417 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 IDH2P48735 452 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TROAPQ12815 778 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 NAB1Q13506 487 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 DNASE1L3Q13609 305 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 DGCR6Q14129 220 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 KCTD21Q4G0X4 260 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 HECTD3Q5T447 861 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ZNF677Q86XU0 584 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TPP1O14773 563 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 LGR5O75473 907 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 LCA5LO95447 670 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 FAM58BPP0C7Q3 252 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 HK2P52789 917 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 BACE1P56817 501 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 NDUFA9Q16795 377 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ARMC3Q5W041 872 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 AVL9Q8NBF6 648 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 COPS4Q9BT78 406 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 FANCFQ9NPI8 374 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ARL5AQ9Y689 179 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 A0A0X1KG70 313 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ENPP3O14638 875 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 OGTO15294 1046 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 HMGCRP04035 888 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SREBF1P36956 1147 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms