RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565324.5

SMG1-211, Transcript of SMG1, nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMG1, Length 12,465 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1-211ENST00000565324 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CTSKP43235 329 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 RPL26P61254 145 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SPATS1Q496A3 300 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 HSD17B12Q53GQ0 312 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ZNF280DQ6N043 979 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 OR5T3Q8NGG3 340 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 NXNL1Q96CM4 212 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 C14orf105Q9NVL8 296 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TLL2Q9Y6L7 1015 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 EPHB3P54753 998 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 NAGLUP54802 743 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ZNF730Q6ZMV8 503 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SNX20Q7Z614 316 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 FAM13CQ8NE31 585 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 DNAJB4Q9UDY4 337 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MAB21L2Q9Y586 359 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PDLIM1O00151 329 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MSH4O15457 936 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ZNF208O43345 1280 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ENTPD5O75356 428 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 IFNA21P01568 189 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 GSTT2P0CG29 244 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CKBP12277 381 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SLC44A5Q8NCS7 719 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TCEAL3Q969E4 200 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SPATA9Q9BWV2 254 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CPS1P31327 1500 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 B8ZZF3 427 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 M0R036 132 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PCDH8O95206 1070 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 HGFP14210 728 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 GRK5P34947 590 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TBX4P57082 545 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SPP2Q13103 211 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MBOAT7Q96N66 472 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 NOTOA8MTQ0 251 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 OR1I1O60431 355 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 OR1E1P30953 314 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 FAAP100Q0VG06 881 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SNAPC2Q13487 334 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 HMBOX1Q6NT76 420 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 KCNK18Q7Z418 384 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 OR2L3Q8NG85 312 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TUBA1CQ9BQE3 449 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 HTATIP2Q9BUP3 242 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 LRRC19Q9H756 370 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 NINJ2Q9NZG7 142 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CDH22Q9UJ99 828 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ERBB2P04626 1255 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PRDX6P30041 224 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 LIPEQ05469 1076 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 BEND5Q7L4P6 421 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PCDH19Q8TAB3 1148 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SEMA4DQ92854 862 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 RNF31Q96EP0 1072 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 APBA2Q99767 749 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TPK1Q9H3S4 243 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 C3orf14Q9HBI5 128 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PCDH10Q9P2E7 1040 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 OR2B6P58173 313 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SLC10A7Q0GE19 358 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ABRQ12979 859 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 BLMHQ13867 455 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 LRRC38Q5VT99 294 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 DSELQ8IZU8 1212 aa5.09□□□□□ -1.59
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