RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCNYL1Q8N7R7 359 aa20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 RCN3Q96D15 328 aa20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADAM2Q99965 735 aa20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBTB26Q9HCK0 441 aa20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 PACSIN3Q9UKS6 424 aa20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 DOCK4Q8N1I0 1966 aa20.37■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 E9PAM4 449 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNFRSF10BO14763 440 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 PSMC3P17980 439 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 DNAJB13P59910 316 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 MS4A2Q01362 244 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 SEPT6Q14141 434 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCD5Q86SK9 330 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 FNDC8Q8TC99 324 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 HM13Q8TCT9 377 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRGBPQ9NV56 204 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 APPL1Q9UKG1 709 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 SZT2Q5T011 3432 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC160A6NGH7 325 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 ENPP3O14638 875 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 COQ9O75208 318 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP6V1B1P15313 513 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 GRIK1P39086 918 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC12A2P55011 1212 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 TUSC3Q13454 348 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 C6orf52Q5T4I8 152 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 C14orf80Q86SX3 495 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 POMKQ9H5K3 350 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 EFCAB1Q9HAE3 211 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 MPP6Q9NZW5 540 aa20.36■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 CPB1P15086 417 aa20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 GK3PQ14409 553 aa20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 NEPROQ6NW34 567 aa20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 IYDQ6PHW0 289 aa20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF554Q86TJ5 538 aa20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 MARK4Q96L34 752 aa20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR41Q9HAD4 459 aa20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNF11Q9Y3C5 154 aa20.35■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRPC5OSA6NMA1 111 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM233B4DJY2 109 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 H3BSA7 217 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM38O00635 465 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 H6PDO95479 791 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 ITGB1P05556 798 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 PAX3P23760 479 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 PBX2P40425 430 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 WNT3AP56704 352 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNSTQ6PJW8 725 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 KDELC1Q6UW63 502 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 ASB9Q96DX5 294 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 SGF29Q96ES7 293 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 SUSD3Q96L08 255 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 NMUR1Q9HB89 426 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A0U1RQF3 1178 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 AURKAO14965 403 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 EFCAB14O75071 495 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 BMP10O95393 424 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCNN1BP51168 640 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 DSC3Q14574 896 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCSK7Q16549 785 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRCH3Q96II8 777 aa20.34■□□□□ 0.85
CCNDBP1-205ENST00000564630 UROC1Q96N76 676 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms