RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 RNF215Q9Y6U7 377 aa8□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 CENPEQ02224 2701 aa8□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 CACNA1DQ01668 2161 aa8□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 FAM72CH0Y354 149 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 INSIG1O15503 277 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 DUX1O43812 170 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 PRKCGP05129 697 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 GLI1P08151 1106 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 JMJD7P0C870 316 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 LIFP15018 202 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 DNA2P51530 1060 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 HK3P52790 923 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 THOP1P52888 689 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 MAPK10P53779 464 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 POLE2P56282 527 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 GNA12Q03113 381 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 ZNF805Q5CZA5 627 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 FAXCQ5TGI0 409 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 FAM72AQ5TYM5 149 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 FAM72DQ6L9T8 149 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 FAM72BQ86X60 149 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 HID1Q8IV36 788 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 WDR48Q8TAF3 677 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 ASB12Q8WXK4 309 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 OR1E3Q8WZA6 343 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 FEM1CQ96JP0 617 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 MED15Q96RN5 788 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 UCN2Q96RP3 112 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 TSG101Q99816 390 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 SPON2Q9BUD6 331 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 RDH14Q9HBH5 336 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 FGF22Q9HCT0 170 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 PLAAQ9Y263 795 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 OR1A2Q9Y585 309 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.99□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 ILVBLA1L0T0 632 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 BLACEA4D250 179 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 K7EM74 188 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 KRIT1O00522 736 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 P4HA2O15460 535 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 TSPAN6O43657 245 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 PIGNO95427 931 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 GM2AP17900 193 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 NR1D1P20393 614 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 OR1E1P30953 314 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 CSF2RBP32927 897 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 MAZP56270 477 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 SLC6A3Q01959 620 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 PPARDQ03181 441 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 KCNAB2Q13303 367 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 SGCGQ13326 291 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 MORC3Q14149 939 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 NFATC4Q14934 902 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 EFHC1Q5JVL4 640 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 BRMS1LQ5PSV4 323 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 KLHL10Q6JEL2 608 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 TRIM65Q6PJ69 517 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 NLRP14Q86W24 1093 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 FAM131BQ86XD5 332 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 PATE1Q8WXA2 126 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 SHC3Q92529 594 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 EDEM3Q9BZQ6 932 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 SIX2Q9NPC8 291 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 TMEM9Q9P0T7 183 aa7.98□□□□□ -1.13
RD3L-201ENST00000557640 LHX3Q9UBR4 397 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms