RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556736.5

MEG3-227, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 1,689 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-227	ENST00000556736	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	SMIM14	Q96QK8	99 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	KXD1	Q9BQD3	176 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	POMK	Q9H5K3	350 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	OR51F1	A6NGY5	319 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	TTC34	A8MYJ7	566 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	S1PR4	O95977	384 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	UGT2B4	P06133	528 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	STMN1	P16949	149 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	NFKBIA	P25963	317 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CRABP2	P29373	138 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	LTBR	P36941	435 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	SLC6A11	P48066	632 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	SLC12A2	P55011	1212 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PARM1	Q6UWI2	310 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	RAPH1	Q70E73	1250 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	TERB1	Q8NA31	727 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	UCMA	Q8WVF2	138 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	VOPP1	Q96AW1	172 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	SCRN2	Q96FV2	425 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	TCF12	Q99081	682 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	IL17C	Q9P0M4	197 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	C2	P06681	752 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PML	P29590	882 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	GDI1	P31150	447 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	GJA4	P35212	333 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	HNF1B	P35680	557 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	STC1	P52823	247 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	RAB10	P61026	200 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	KDSR	Q06136	332 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	GRIN2C	Q14957	1233 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CNST	Q6PJW8	725 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	GPATCH11	Q8N954	259 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CHST14	Q8NCH0	376 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	MYLIP	Q8WY64	445 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	FGF14	Q92915	247 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
MEG3-227	ENST00000556736	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	PRRT4	C9JH25	899 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	COL6A2	P12110	1019 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	MC4R	P32245	332 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	SERPINB4	P48594	390 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	CSRP3	P50461	194 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	PPM1J	Q5JR12	505 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	NXPE3	Q969Y0	559 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	FAM107B	Q9H098	131 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	IL36A	Q9UHA7	158 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	TAC1	P20366	129 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	SAT1	P21673	171 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	DRD4	P21917	467 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	OPRD1	P41143	372 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	DBN1	Q16643	649 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	CCDC153	Q494R4	210 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	CLEC14A	Q86T13	490 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		18.19	■□□□□ 0.5

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