RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556591.1

CFAP54-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 54, human

TSL 5

Gene CFAP54, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP54-208	ENST00000556591	KDM4B	O94953	1096 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	MBD4	O95243	580 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	FTCD	O95954	541 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	HOXB5	P09067	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	TGFB3	P10600	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PBX3	P40426	434 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	TSPAN7	P41732	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	TAF1	P21675	1872 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PAGE4	O60829	102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	GAGE7	O76087	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	MAOA	P21397	527 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	OLR1	P78380	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	GAGE1	Q13065	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	GAGE4	Q13068	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CCNG2	Q16589	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CALCRL	Q16602	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	NKX2-2	O95096	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PMS2P2	O95744	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	CLEC3B	P05452	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SRC	P12931	536 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	KRT10	P13645	584 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	COASY	Q13057	564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SNTA1	Q13424	505 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	OLIG2	Q13516	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591		A0A1W2PQF6	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CFAP54-208	ENST00000556591	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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