RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545964.1

MDM1-215, Transcript of Mdm1 nuclear protein, human

TSL 2

Gene MDM1, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM1-215	ENST00000545964	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	GNA12	Q03113	381 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	MTA1	Q13330	715 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	FGL2	Q14314	439 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	INPP5A	Q14642	412 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	NR0B2	Q15466	257 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	GUSBP11	Q6P575	273 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	FAM131B	Q86XD5	332 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	JAML	Q86YT9	394 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	NPY6R	Q99463	290 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964		U3KQE9	123 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	FANCG	O15287	622 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	YY2	O15391	372 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	TSPAN6	O43657	245 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	BUB1	O43683	1085 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	SLC28A2	O43868	658 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	DAB1	O75553	588 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	ZMPSTE24	O75844	475 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	GJB6	O95452	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	UGT2B4	P06133	528 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	GP1BA	P07359	652 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	ANXA6	P08133	673 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	ADRB3	P13945	408 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	TSHR	P16473	764 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	ADRA1B	P35368	520 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	RHD	Q02161	417 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM1-215	ENST00000545964	BECN1	Q14457	450 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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