RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540401.5

CCDC91-210, Transcript of coiled-coil domain containing 91, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC91, Length 1,439 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC91-210ENST00000540401 E5RJQ4 531 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 CHL1O00533 1208 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 ATG13O75143 517 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 MTX1Q13505 466 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 ADIPOQQ15848 244 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 KRT24Q2M2I5 525 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 PCGF3Q3KNV8 242 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 LINGO2Q7L985 606 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 KRT77Q7Z794 578 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 DNAAF5Q86Y56 855 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 WDR63Q8IWG1 891 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 SFTPA2Q8IWL1 248 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 APPL2Q8NEU8 664 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 SLC35F5Q8WV83 523 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 ERGIC1Q969X5 290 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 OTULINQ96BN8 352 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 VCPIP1Q96JH7 1222 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 GCNAQ96QF7 691 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 GAD1Q99259 594 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 PAFAH2Q99487 392 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 MSTO1Q9BUK6 570 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 HRH4Q9H3N8 390 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 LTB4R2Q9NPC1 389 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 GPR108Q9NPR9 543 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 FLRT1Q9NZU1 646 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 PADI1Q9ULC6 663 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.77
CCDC91-210ENST00000540401 A0A1W2PRQ8 180 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 UBE2CO00762 179 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 VCYO14598 125 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 MDM4O15151 490 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 CYC1P08574 325 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 MYF6P23409 242 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 LMAN1P49257 510 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 UBXN2AP68543 259 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 TFAP4Q01664 338 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 TNFAIP1Q13829 316 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 MMEL1Q495T6 779 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 Q4G0T1 1027 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 TMEM198Q66K66 360 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 NUGGCQ68CJ6 796 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 AACSQ86V21 672 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 TEX45Q8NA69 505 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 AVL9Q8NBF6 648 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 ENGASEQ8NFI3 743 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 ARRDC2Q8TBH0 407 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 BICD2Q8TD16 824 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 CCDC34Q96HJ3 373 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 HARBI1Q96MB7 349 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 SEMA4CQ9C0C4 833 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 PRSS22Q9GZN4 317 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 TASP1Q9H6P5 420 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.786e-7■■■■■ 29.4
CCDC91-210ENST00000540401 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 TAB2Q9NYJ8 693 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 CMAHPQ9Y471 501 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 H7C0S8 307 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 ATP2A1O14983 1001 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 OGG1O15527 345 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 MITFO75030 526 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 JRKO75564 520 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 CHATP28329 748 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 PIGAP37287 484 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 STAT2P52630 851 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 PPP5CP53041 499 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 P2RX3P56373 397 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 TAS2R40P59535 323 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 PSMD6Q15008 389 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 DUSP6Q16828 381 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 ANKRD54Q6NXT1 300 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 DPPA4Q7L190 304 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 ADGRA1Q86SQ6 560 aa3.95□□□□□ -1.78
CCDC91-210ENST00000540401 PALB2Q86YC2 1186 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms