RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 LRRC38Q5VT99 294 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SLC9A4Q6AI14 798 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 CHSY3Q70JA7 882 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PGAM4Q8N0Y7 254 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 C7orf57Q8NEG2 295 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SLCO4A1Q96BD0 722 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM80Q96HE8 168 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 IFT22Q9H7X7 185 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 CD320Q9NPF0 282 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 DGKBQ9Y6T7 804 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 CENPXA8MT69 81 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PI15O43692 258 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 CILPO75339 1184 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 UPK1BO75841 260 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SLITRK5O94991 958 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PTTG1O95997 202 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 BMP2P12643 396 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 IL1R2P27930 398 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 HAAOP46952 286 aa8.49□□□□□ -1.05
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TRPS1-209ENST00000519674 RHDQ02161 417 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 LAPTM5Q13571 262 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 FAM187BQ17R55 369 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ZFP69Q49AA0 526 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 Q5BKY6 102 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF773Q6PK81 442 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ILDR2Q71H61 639 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 FBXO36Q8NEA4 188 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 HPDLQ96IR7 371 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 LHPPQ9H008 270 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 MUC3BQ9H195 1237 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 LHX5Q9H2C1 402 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 MICAL2O94851 1124 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 GSRP00390 522 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 GOT2P00505 430 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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TRPS1-209ENST00000519674 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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TRPS1-209ENST00000519674 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 MAPRE2Q15555 327 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 DPP9Q86TI2 863 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 XYLT1Q86Y38 959 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 UBA3Q8TBC4 463 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ASB9Q96DX5 294 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 RNF170Q96K19 258 aa8.48□□□□□ -1.05
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TRPS1-209ENST00000519674 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ASB7Q9H672 318 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SCN1AP35498 2009 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SGK1O00141 431 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 CTDSP2O14595 271 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 AIM2O14862 343 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ABCB7O75027 752 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 INHBAP08476 426 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 RALBP11234 206 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 ATF6P18850 670 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 CYP2C18P33260 490 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 EVI2BP34910 448 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-209ENST00000519674 PLA2G16P53816 162 aa8.48□□□□□ -1.05
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