RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 MIDNQ504T8 468 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM171A1Q5VUB5 890 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAAH2Q6GMR7 532 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 AADACL2Q6P093 401 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 GJB7Q6PEY0 223 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 LRRC8AQ8IWT6 810 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 MMP21Q8N119 569 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 GHDCQ8N2G8 530 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SCAIQ8N9R8 606 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CNBD1Q8NA66 436 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC112Q8NEF3 446 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 NSMCE1Q8WV22 266 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC25A28Q96A46 364 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SKA1Q96BD8 255 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZBTB10Q96DT7 871 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 APOPT1Q96IL0 206 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 EYA3Q99504 573 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 IFT27Q9BW83 186 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 AGXT2Q9BYV1 514 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TNMDQ9H2S6 317 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 Q9N2J8 555 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF532Q9HCE3 1301 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 MED23Q9ULK4 1368 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF609O15014 1411 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 BCL9LQ86UU0 1499 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 DOT1LQ8TEK3 1739 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 NWD2Q9ULI1 1742 aa4.35□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC69A6NI79 296 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD8B2A6NJW9 211 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 B4DGG1 531 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 PROB1E7EW31 1015 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 NDUFB8O95169 186 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CBX6O95503 412 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD4P01730 458 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TNFRSF1BP20333 461 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD72P21854 359 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ABCD3P28288 659 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CIITAP33076 1130 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 GYG1P46976 350 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 MTNR1AP48039 350 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CASP6P55212 293 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDH15P55291 814 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.34□□□□□ -1.716e-6■■□□□ 12.1
TIMMDC1-209ENST00000498399 CAMK1Q14012 370 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SEMA3AQ14563 771 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CAMK4Q16566 473 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 C5orf22Q49AR2 442 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 MANEAQ5SRI9 462 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM69AQ5T7M9 428 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM173BQ6P4H8 233 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 MFSD6Q6ZSS7 791 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMIM5Q71RC9 77 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CHST3Q7LGC8 479 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CREBRFQ8IUR6 639 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ARMC8Q8IUR7 673 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRT222Q8N1A0 295 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM217Q8N7C4 229 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 KAT2AQ92830 837 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 EME1Q96AY2 570 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ELP4Q96EB1 424 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ERO1AQ96HE7 468 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 FUZQ9BT04 418 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TUBB6Q9BUF5 446 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 LRRC2Q9BYS8 371 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRT23Q9C075 422 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 LMAN2LQ9H0V9 348 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM234AQ9H0X4 552 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 EPHX3Q9H6B9 360 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 VEZTQ9HBM0 779 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 HDAC6Q9UBN7 1215 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 RCOR1Q9UKL0 485 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CFAP45Q9UL16 551 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 OSGIN2Q9Y236 505 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SHANK3Q9BYB0 1731 aa4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms