RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 INSIG1O15503 277 aa23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 NRDCO43847 1150 aa23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 TNFP01375 233 aa23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 WT1P19544 449 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 SPA17Q15506 151 aa23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 UGP2Q16851 508 aa23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 NTAN1Q96AB6 310 aa23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 HMCESQ96FZ2 354 aa23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 KLC2Q9H0B6 622 aa23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 PCDH12Q9NPG4 1184 aa23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 UVRAGQ9P2Y5 699 aa23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 LHX3Q9UBR4 397 aa23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa23.23■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
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SIMC1-208ENST00000495423 TMEM253P0C7T8 217 aa23.22■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 TCEAL1Q15170 157 aa23.22■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 C14orf28Q4W4Y0 310 aa23.22■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 COLEC12Q5KU26 742 aa23.22■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM139Q8IV31 216 aa23.22■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.22■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC185Q8N715 623 aa23.22■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 USP7Q93009 1102 aa23.22■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 CNPY3Q9BT09 278 aa23.22■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 RNF215Q9Y6U7 377 aa23.22■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 NDUFA10O95299 355 aa23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 PIGNO95427 931 aa23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 GPD1P21695 349 aa23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 MMP12P39900 470 aa23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 LIG3P49916 1009 aa23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 HDAC4P56524 1084 aa23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 KIAA1024LP59773 190 aa23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 GRM3Q14832 879 aa23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF354CQ86Y25 554 aa23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 NETO2Q8NC67 525 aa23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 JOSD2Q8TAC2 188 aa23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 HTR3CQ8WXA8 447 aa23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 OR1E3Q8WZA6 343 aa23.21■■□□□ 1.31
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SIMC1-208ENST00000495423 SUV39H2Q9H5I1 410 aa23.21■■□□□ 1.31
SIMC1-208ENST00000495423 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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SIMC1-208ENST00000495423 SLC25A18Q9H1K4 315 aa23.2■■□□□ 1.3
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SIMC1-208ENST00000495423 LRIT1Q9P2V4 623 aa23.2■■□□□ 1.3
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SIMC1-208ENST00000495423 TMEM202A6NGA9 273 aa23.19■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 CYP4F2P78329 520 aa23.19■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 SERINC3Q13530 473 aa23.19■■□□□ 1.3
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SIMC1-208ENST00000495423 PARP15Q460N3 678 aa23.19■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 TAF8Q7Z7C8 310 aa23.19■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 SFTPA2Q8IWL1 248 aa23.19■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23.19■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 PLA2G15Q8NCC3 412 aa23.19■■□□□ 1.3
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SIMC1-208ENST00000495423 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa23.19■■□□□ 1.3
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SIMC1-208ENST00000495423 TNFRSF10CO14798 259 aa23.18■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 RASA4O43374 803 aa23.18■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 MTA2O94776 668 aa23.18■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 EPHB2P29323 1055 aa23.18■■□□□ 1.3
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SIMC1-208ENST00000495423 AIF1P55008 147 aa23.18■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 B4GALNT1Q00973 533 aa23.18■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 ARHGEF7Q14155 803 aa23.18■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 CLCA4Q14CN2 919 aa23.18■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 C16orf72Q14CZ0 275 aa23.18■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 PHF19Q5T6S3 580 aa23.18■■□□□ 1.3
SIMC1-208ENST00000495423 ADNPQ9H2P0 1102 aa23.18■■□□□ 1.3
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