RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR73Q6P4I2 378 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 QSOX2Q6ZRP7 698 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SATL1Q86VE3 508 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR63Q8IWG1 891 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSPYL6Q8N831 410 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL17REQ8NFR9 667 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATA20Q8TB22 786 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC41A2Q96JW4 573 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MMP25Q9NPA2 562 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIX4Q9UIU6 781 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LDB3O75112 727 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT36O76013 467 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAS8-AS1O95177 125 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 F7P08709 466 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXB5P09067 269 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDAP32320 146 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDIT3P35638 169 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFAIP1Q13829 316 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GORABQ5T7V8 394 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAOK1Q7L7X3 1001 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HAPLN4Q86UW8 402 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NAGSQ8N159 534 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATA6LQ8N4H0 392 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CADM4Q8NFZ8 388 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNASE2BQ8WZ79 361 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KXD1Q9BQD3 176 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBTD1Q9HAC8 227 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EBF2Q9HAK2 575 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDH9Q9HC56 1237 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TXLNGQ9NUQ3 528 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEPT1Q9Y6K0 416 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A087WYN8 130 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP17L23D6RBM5 183 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLGNO14967 610 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF432O94892 652 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FTCDO95954 541 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AGR2O95994 175 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SORDQ00796 357 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB17Q13105 803 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGFBP1Q14512 234 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GSTA3Q16772 222 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT24Q2M2I5 525 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC45A4Q5BKX6 768 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C9orf50Q5SZB4 431 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TUBA1AQ71U36 451 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARMC8Q8IUR7 673 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DSELQ8IZU8 1212 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FIG4Q92562 907 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZUFSPQ96AP4 578 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SH3GL2Q99962 352 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TUBA1CQ9BQE3 449 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR108Q9NPR9 543 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ICAM5Q9UMF0 924 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAPN7Q9Y6W3 813 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CGNL1Q0VF96 1302 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKHD1A6NEE1 506 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC53A6NM62 1247 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNAP23O00161 211 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BUB3O43684 328 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDX5P17844 614 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEXNQ0ZGT2 675 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NAE1Q13564 534 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COL28A1Q2UY09 1125 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POC1AQ8NBT0 407 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAAL1Q96ER3 474 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM19Q96HH6 336 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDST4Q9H3R1 872 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYH16Q9H6N6 1097 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EVA1AQ9H8M9 152 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PREBQ9HCU5 417 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC6A13Q9NSD5 602 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms