RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 CDKN3Q16667 212 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 IL27RAQ6UWB1 636 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PRUNE1Q86TP1 453 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PACS2Q86VP3 889 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 IQCHQ86VS3 1027 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SLC25A41Q8N5S1 370 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PLA2G15Q8NCC3 412 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 IPMKQ8NFU5 416 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 COG1Q8WTW3 980 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SKA1Q96BD8 255 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 IFT43Q96FT9 208 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 WDR24Q96S15 920 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 LYSMD1Q96S90 227 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 GPR27Q9NS67 375 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 A0A1B0GTQ1 180 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PSMD11O00231 422 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 TM4SF5O14894 197 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ZNF185O15231 689 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 FANCGO15287 622 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 OPHN1O60890 802 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 GCATO75600 419 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 METTL18O95568 372 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 NDST3O95803 873 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ZNF30P17039 623 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 MSNP26038 577 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ETV3P41162 512 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 RABIFP47224 123 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 KCNJ1P48048 391 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 STC1P52823 247 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 GEMP55040 296 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 GNG11P61952 73 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 OVGP1Q12889 678 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 MPP3Q13368 585 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 INPP5AQ14642 412 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SLC1A5Q15758 541 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SIRPB2Q5JXA9 342 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 FAXCQ5TGI0 409 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 Q6ZVL8 140 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PRELID2Q8N945 189 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 EID2BQ96D98 161 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 RTP4Q96DX8 246 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 NUS1Q96E22 293 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 DTD2Q96FN9 168 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PBKQ96KB5 322 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 APOL2Q9BQE5 337 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 FICDQ9BVA6 458 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ADGRE3Q9BY15 652 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 GDF3Q9NR23 364 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 CD84Q9UIB8 345 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SNX12Q9UMY4 172 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 ZNF711Q9Y462 761 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 OR1A2Q9Y585 309 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 TMEM131Q92545 1883 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-216ENST00000495123 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.64□□□□□ -1.03
PKP4-216ENST00000495123 K7ESM1 405 aa8.64□□□□□ -1.03
PKP4-216ENST00000495123 AURKAO14965 403 aa8.64□□□□□ -1.03
PKP4-216ENST00000495123 MAGEC1O60732 1142 aa8.64□□□□□ -1.03
PKP4-216ENST00000495123 USP12O75317 370 aa8.64□□□□□ -1.03
PKP4-216ENST00000495123 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PKP4-216ENST00000495123 ANXA9O76027 345 aa8.64□□□□□ -1.03
PKP4-216ENST00000495123 AGTP01019 485 aa8.64□□□□□ -1.03
PKP4-216ENST00000495123 IFNB1P01574 187 aa8.64□□□□□ -1.03
PKP4-216ENST00000495123 EPOP01588 193 aa8.64□□□□□ -1.03
PKP4-216ENST00000495123 SLC4A1P02730 911 aa8.64□□□□□ -1.03
PKP4-216ENST00000495123 ITGAVP06756 1048 aa8.64□□□□□ -1.03
PKP4-216ENST00000495123 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.64□□□□□ -1.03
PKP4-216ENST00000495123 CD59P13987 128 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms