RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 TBX4P57082 545 aa6.56□□□□□ -1.36
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PRPF40A-210ENST00000489741 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-210ENST00000489741 GOT1P17174 413 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-210ENST00000489741 TACR2P21452 398 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC8A1P32418 973 aa6.54□□□□□ -1.36
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PRPF40A-210ENST00000489741 ACADSBP45954 432 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-210ENST00000489741 ST8SIA6P61647 398 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-210ENST00000489741 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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