RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ATP8B1	O43520	1251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TSPAN3	O60637	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	IL1B	P01584	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	C1S	P09871	688 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CASP4	P49662	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DAOA	P59103	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TNK2	Q07912	1038 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ELP6	Q0PNE2	266 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	RAB7B	Q96AH8	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	OMA1	Q96E52	524 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	C8orf4	Q9NR00	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FZD6	O60353	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MYBL1	P10243	752 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63	4e-9	■■■■■ 29.4
KRIT1-222	ENST00000486261	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CCR2	P41597	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GPR15	P49685	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	AIF1	P55008	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CDH4	P55283	916 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NME3	Q13232	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MAML1	Q92585	1016 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	COQ7	Q99807	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SMO	Q99835	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ATRX	P46100	2492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	BLACE	A4D250	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261		O00370	1275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CTSE	P14091	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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