RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 DMTF1Q9Y222 760 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CRYL1Q9Y2S2 319 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 SNX13Q9Y5W8 968 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 RPP40O75818 363 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CNTN5O94779 1100 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 FGF4P08620 206 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ATP6V1B1P15313 513 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 OGNP20774 298 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 YWHAQP27348 245 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CREB5Q02930 508 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ACVR1Q04771 509 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF235Q14590 738 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 LPIN1Q14693 890 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 NADK2Q4G0N4 442 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ALFQ53S48 1182 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM207Q6UWW9 146 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 LAYNQ6UX15 382 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 OR52K2Q8NGK3 314 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 RHEBL1Q8TAI7 183 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ARRDC2Q8TBH0 407 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 LRTOMTQ8WZ04 291 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 EXT2Q93063 718 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 SLC2A11Q9BYW1 496 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 COQ10BQ9H8M1 238 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 GMIPQ9P107 970 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 AZIN1O14977 448 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 INPPL1O15357 1258 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 VPS4BO75351 444 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 OR6B1O95007 311 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 OAZ2O95190 189 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 GOT2P00505 430 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ETFBP38117 255 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 SLC7A2P52569 658 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 MTA1Q13330 715 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 SERINC3Q13530 473 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 IKBKEQ14164 716 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 MFSD14CQ5VZR4 134 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 RAP1GAP2Q684P5 730 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 GLB1LQ6UWU2 654 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 C17orf99Q6UX52 265 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 PIM3Q86V86 326 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 MIER2Q8N344 545 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 OR2T34Q8NGX1 318 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 OR2T3Q8NH03 318 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ZUFSPQ96AP4 578 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 PTERQ96BW5 349 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TBATAQ96M53 351 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 SEMA3CQ99985 751 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 AKTIPQ9H8T0 292 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CATSPERZQ9NTU4 200 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 GID8Q9NWU2 228 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 RIMKLBQ9ULI2 386 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 A0A0J9YYE9 177 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 OR51F1A6NGY5 319 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CCL22O00626 93 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ANGPT2O15123 496 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ATP6AP2O75787 350 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 EPOP01588 193 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TSPAN8P19075 237 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 HDCP19113 662 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 GPX3P22352 226 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 MAPKAPK2P49137 400 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 SUOXP51687 545 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 NAA20P61599 178 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 APOFQ13790 326 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 INPP5AQ14642 412 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 RPS6KA2Q15349 733 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 NRF1Q16656 503 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 DDR2Q16832 855 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 SDHAF4Q5VUM1 108 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CYP2R1Q6VVX0 501 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 BBS5Q8N3I7 341 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TRPV1Q8NER1 839 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
C9orf3-218ENST00000482056 SYTL2Q9HCH5 934 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.3 ms