RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 IL7RP16871 459 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNC1P48547 511 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 PKN3Q6P5Z2 889 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC80Q76M96 950 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 TTC39CQ8N584 583 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 OR13F1Q8NGS4 319 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNA7Q96RP8 456 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 NPY6RQ99463 290 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 ADNPQ9H2P0 1102 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 GIN1Q9NXP7 522 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 GJA3Q9Y6H8 435 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 H3BMM5 538 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 TSPAN1O60635 241 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 HUS1O60921 280 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 PMPCBO75439 489 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 GFAPP14136 432 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 JAK1P23458 1154 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 ADRA1BP35368 520 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 TMBIM6P55061 237 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP6V0D1P61421 351 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 FBXO48Q5FWF7 155 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 SPRED1Q7Z699 444 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 WNT8BQ93098 351 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 VPS33AQ96AX1 596 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM74Q96NL1 305 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 C1orf50Q9BV19 199 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 DGCR6LQ9BY27 220 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 GSTO2Q9H4Y5 243 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 PDGFCQ9NRA1 345 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 BTRCQ9Y297 605 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 A8MU76 341 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 DFFAO00273 331 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 AXIN1O15169 862 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 MAN1A2O60476 641 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 XYLBO75191 536 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 CLPXO76031 633 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC6A2P23975 617 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 DNAJB1P25685 340 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXA1P55317 472 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 SPCS2Q15005 226 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 OXA1LQ15070 435 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 UGP2Q16851 508 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 TMTC4Q5T4D3 741 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 ITIH5Q86UX2 942 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 PDZD8Q8NEN9 1154 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 TEKT5Q96M29 485 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIM15Q9C019 465 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 HOXC10Q9NYD6 342 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 KLK14Q9P0G3 267 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 FBXO5Q9UKT4 447 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 CITO14578 2027 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 AQP12BA6NM10 295 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 DAB1O75553 588 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 EDNRBP24530 442 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 AKAP5P24588 427 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 AXLP30530 894 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 HLCSP50747 726 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 RAD23AP54725 363 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 DNAJB13P59910 316 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 PSMD5Q16401 504 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 IMPG1Q17R60 797 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 PIM3Q86V86 326 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 AQP12AQ8IXF9 295 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 PDPRQ8NCN5 879 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 TRPV3Q8NET8 790 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 SNX27Q96L92 541 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 TBL1YQ9BQ87 522 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 ING2Q9H160 280 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 AQP9O43315 295 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 PCNAP12004 261 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 RFC2P35250 354 aa13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms