RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460981.1

REV3L-208, Transcript of REV3 like, DNA directed polymerase zeta catalytic subunit, human

TSL 2

Gene REV3L, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REV3L-208	ENST00000460981	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	WBP2	Q969T9	261 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	HSPA12A	O43301	675 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	KLK8	O60259	260 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	SP1	P08047	785 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	IL7R	P16871	459 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	BDNF	P23560	247 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	BNC1	Q01954	994 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	MYBPH	Q13203	477 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	SEC14L5	O43304	696 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	TNFSF14	O43557	240 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	NDUFB4	O95168	129 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	CYC1	P08574	325 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	SPARC	P09486	303 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	UBL4A	P11441	157 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	ZNF12	P17014	697 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	SHMT1	P34896	483 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	RGS2	P41220	211 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	DCAF7	P61962	342 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	TRAF2	Q12933	501 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	RND1	Q92730	232 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV3L-208	ENST00000460981	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REV3L-208	ENST00000460981	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REV3L-208	ENST00000460981	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
REV3L-208	ENST00000460981	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
REV3L-208	ENST00000460981	MMP2	P08253	660 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REV3L-208	ENST00000460981	STX2	P32856	288 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REV3L-208	ENST00000460981	PEX5	P50542	639 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REV3L-208	ENST00000460981	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REV3L-208	ENST00000460981	NAE1	Q13564	534 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REV3L-208	ENST00000460981	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76

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