RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460211.5

ATG4B-213, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ATG4B-213ENST00000460211 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-213ENST00000460211 NOMO1Q15155 1222 aa14.94□□□□□ -0.02
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ATG4B-213ENST00000460211 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.94□□□□□ -0.02
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