RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	RMDN1	Q96DB5	314 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	DTD2	Q96FN9	168 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TBATA	Q96M53	351 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CDH19	Q9H159	772 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TRABD	Q9H4I3	376 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
PTPA-222	ENST00000445241	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	FLRT2	O43155	660 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	FGG	P02679	453 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	PRKCG	P05129	697 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	ITGAV	P06756	1048 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	TSHR	P16473	764 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	GM2A	P17900	193 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM23	P36406	574 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	STC1	P52823	247 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	WNT3A	P56704	352 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN2	P57739	230 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	ACOX1	Q15067	660 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC66	Q68CR7	880 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	C4orf22	Q6V702	233 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	PIP4P1	Q86T03	277 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	PARG	Q86W56	976 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	NUS1	Q96E22	293 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	MYOC	Q99972	504 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	RAD18	Q9NS91	495 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	HACD3	Q9P035	362 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	PSMD3	O43242	534 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	CEP104	O60308	925 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	PMPCB	O75439	489 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	FGF1	P05230	155 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	ALPI	P09923	528 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	CD59	P13987	128 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	CTPS1	P17812	591 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	HTR1B	P28222	390 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	ACTN2	P35609	894 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	THOP1	P52888	689 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA1024L	P59773	190 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	PTS	Q03393	145 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	CDKN3	Q16667	212 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	PARP6	Q2NL67	630 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	MACC1	Q6ZN28	852 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35F6	Q8N357	371 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	SLC32A1	Q9H598	525 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	LRP4	O75096	1905 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	CACNA1A	O00555	2505 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241		H3BM21	787 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	ENC1	O14682	589 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	TNFRSF10C	O14798	259 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	CEACAM1	P13688	526 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	KEL	P23276	732 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	BLK	P51451	505 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	DCDC1	P59894	354 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	FZD2	Q14332	565 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	GALNT3	Q14435	633 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	INPP5A	Q14642	412 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	NFATC4	Q14934	902 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	SLC1A5	Q15758	541 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	PCSK7	Q16549	785 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	PNCK	Q6P2M8	343 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PTPA-222	ENST00000445241	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		14.62	□□□□□ -0.07

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