RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439984.7

PCNX1-202, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNX1, Length 6,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-202ENST00000439984 CD36P16671 472 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 GPSM1Q86YR5 675 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 MEIOBQ8N635 442 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 GSTT2P0CG29 244 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 GSTT2BP0CG30 244 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 STAG3L1P0CL83 205 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ALDH9A1P49189 494 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 AADATQ8N5Z0 425 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 GANCQ8TET4 914 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CHIAQ9BZP6 476 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.68□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ADIGQ0VDE8 80 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CCDC157Q569K6 752 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 FUOMA2VDF0 154 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 PLIN3O60664 434 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CHRNGP07510 517 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CETPP11597 493 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 COX7A2P14406 83 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 MAPKAPK2P49137 400 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 JAM2P57087 298 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF614Q8N883 585 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CD4P01730 458 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 IDO1P14902 403 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 SYT12Q8IV01 421 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 FUT4P22083 530 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CTSKP43235 329 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 GPR65Q8IYL9 337 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 NCAM2O15394 837 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 HMGCS2P54868 508 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 OLR1P78380 273 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 DEFB106AQ8N104 65 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 TNFRSF25Q93038 417 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 PRKACBP22694 351 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 NFKB1P19838 968 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CCNCP24863 283 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 MPP2Q14168 576 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 PGRP06401 933 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CLTBP09497 229 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ERAP2Q6P179 960 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 LEMD2Q8NC56 503 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 MSANTD3Q96H12 275 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 LRATO95237 230 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 IL1R1P14778 569 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 NOS3P29474 1203 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 RXRGP48443 463 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 TKTL1P51854 596 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 GDF10P55107 478 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 SLC6A3Q01959 620 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 RELAQ04206 551 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 KRT78Q8N1N4 520 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 BEX2Q9BXY8 128 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 FAM25EA8MYX2 175 aa14.66□□□□□ -0.06
PCNX1-202ENST00000439984 SLC22A1O15245 554 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms