RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 MED8Q96G25 268 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 FAM81BQ96LP2 452 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 IL12RB2Q99665 862 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 SPASTQ9UBP0 616 aa6.62□□□□□ -1.35
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HOXD8-202ENST00000429017 PADI4Q9UM07 663 aa6.62□□□□□ -1.35
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HOXD8-202ENST00000429017 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.62□□□□□ -1.35
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HOXD8-202ENST00000429017 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.61□□□□□ -1.35
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HOXD8-202ENST00000429017 CCDC14Q49A88 953 aa6.61□□□□□ -1.35
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HOXD8-202ENST00000429017 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 ZAR1Q86SH2 424 aa6.61□□□□□ -1.35
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HOXD8-202ENST00000429017 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.61□□□□□ -1.35
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HOXD8-202ENST00000429017 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 RAB7BQ96AH8 199 aa6.61□□□□□ -1.35
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HOXD8-202ENST00000429017 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM4Q9C037 500 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 CLMPQ9H6B4 373 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.61□□□□□ -1.35
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HOXD8-202ENST00000429017 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.61□□□□□ -1.35
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HOXD8-202ENST00000429017 CCDC185Q8N715 623 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 GPT2Q8TD30 523 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 NAT6Q93015 286 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
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