RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 PELI3Q8N2H9 469 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 TEX26Q8N6G2 289 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 NSMCE1Q8WV22 266 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 DTD2Q96FN9 168 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 SCRN2Q96FV2 425 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM74Q96NL1 305 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 LGR4Q9BXB1 951 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 TEX101Q9BY14 249 aa21.01■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 TMEM168Q9H0V1 697 aa21.01■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 PPIL1Q9Y3C6 166 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 PLD2O14939 933 aa21■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 TNFSF15O95150 251 aa21■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 CCL7P80098 99 aa21■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 ZBED6P86452 979 aa21■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 TCEA2Q15560 299 aa21■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 C14orf28Q4W4Y0 310 aa21■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 FAM46DQ8NEK8 389 aa21■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa21■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 CPNE5Q9HCH3 593 aa21■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 CYP4F12Q9HCS2 524 aa21■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 ACSL6Q9UKU0 697 aa21■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.99■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 PGLSO95336 258 aa20.99■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 LHCGRP22888 699 aa20.99■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 VAC14Q08AM6 782 aa20.99■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1524Q8TCG1 905 aa20.99■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 GPBAR1Q8TDU6 330 aa20.99■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.98■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.98■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 SPRED1Q7Z699 444 aa20.98■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 HEATR4Q86WZ0 1026 aa20.98■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 BTBD6Q96KE9 485 aa20.98■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.98■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 A0A087X0T9 212 aa20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 CAPN8A6NHC0 703 aa20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 B4DGG1 531 aa20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 K7ENP7 123 aa20.97■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 FAM228BP0C875 321 aa20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 UGT1A5P35504 534 aa20.97■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 MAXP61244 160 aa20.97■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP40Q5TG30 622 aa20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 LUZP1Q86V48 1076 aa20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.97■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 CCL4L1Q8NHW4 92 aa20.97■□□□□ 0.95
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