RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427445.6

TPTE-201, Transcript of transmembrane phosphatase with tensin homology, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPTE, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE-201ENST00000427445 ACVR1Q04771 509 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 SEPT6Q14141 434 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 KIF19Q2TAC6 998 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 UNC50Q53HI1 259 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 KANK2Q63ZY3 851 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 FAM171BQ6P995 826 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 Q6ZNX1 250 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 METTL23Q86XA0 190 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 PROSER1Q86XN7 944 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 BORCS5Q969J3 196 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 SLC39A8Q9C0K1 460 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 CCDC68Q9H2F9 335 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 RNF39Q9H2S5 420 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 MYBPHLA2RUH7 354 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 NEMP2A6NFY4 417 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 HAS3O00219 553 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 NME4O00746 187 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 PMPCBO75439 489 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 CYP11A1P05108 521 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 SLC2A3P11169 496 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 ZNF12P17014 697 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 OGNP20774 298 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 KCNA5P22460 613 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 FDXRP22570 491 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 CAPGP40121 348 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 TUBA3CQ13748 450 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 GRB14Q14449 540 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 MFSD10Q14728 455 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 ISCA2Q86U28 154 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 SLC15A3Q8IY34 581 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 ADGRG5Q8IZF4 528 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 CBR4Q8N4T8 237 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 SMYD1Q8NB12 490 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 SMOXQ9NWM0 555 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.9□□□□□ -0.82
TPTE-201ENST00000427445 MYLKQ15746 1914 aa9.9□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 NUP205Q92621 2012 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 THP07101 528 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 GFAPP14136 432 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 FXNQ16595 210 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 MRNIPQ6NTE8 343 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 KLHL35Q6PF15 583 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 CYHR1Q6ZMK1 362 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 ZNF786Q8N393 782 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 DHRSXQ8N5I4 330 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 EDEM1Q92611 657 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 MYLPFQ96A32 169 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 TADA1Q96BN2 335 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 LRRC58Q96CX6 371 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 RDH12Q96NR8 316 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 TINF2Q9BSI4 451 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 ACSS2Q9NR19 701 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 MAP10Q9P2G4 905 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 ZNF639Q9UID6 485 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 GIT1Q9Y2X7 761 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 FIS1Q9Y3D6 152 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 SNX10Q9Y5X0 201 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 A0A1W2PP18 115 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 CCDC78A2IDD5 438 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 ADM5C9JUS6 153 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 UBXN8O00124 270 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 FXYD1O00168 92 aa9.89□□□□□ -0.83
TPTE-201ENST00000427445 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms