RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 DDX58O95786 925 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 SCGB1D1O95968 90 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 LAMP2P13473 410 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 RARGP13631 454 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 SSTR2P30874 369 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 STX2P32856 288 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 LTBQ06643 244 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 MAMLD1Q13495 774 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 RALBP1Q15311 655 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 NCEH1Q6PIU2 408 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 IKBIPQ70UQ0 350 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 WDR63Q8IWG1 891 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 DSELQ8IZU8 1212 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 CLIP4Q8N3C7 705 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 SPATA6LQ8N4H0 392 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 NEK9Q8TD19 979 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 RND1Q92730 232 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 PHF21BQ96EK2 531 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 LYZL4Q96KX0 146 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 CSF3RQ99062 836 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 KXD1Q9BQD3 176 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 KCNN2Q9H2S1 579 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 HIPK2Q9H2X6 1198 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 MUC13Q9H3R2 512 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 NOX4Q9NPH5 578 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 CNGB3Q9NQW8 809 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 SNX9Q9Y5X1 595 aa4.3□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 A0A1W2PRG0 241 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 LIPT2A6NK58 231 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 VCYO14598 125 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 NDUFS7O75251 213 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 FTCDO95954 541 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 T-ENOLP0DO92 83 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 ACADMP11310 421 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 ZNF12P17014 697 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 PDLIM4P50479 330 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 CLCN3P51790 818 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 ARF1P84077 181 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 EGR4Q05215 589 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 TRAF2Q12933 501 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 XKR9Q5GH70 373 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 EFHC1Q5JVL4 640 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 SLC36A4Q6YBV0 504 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 NEK10Q6ZWH5 1172 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 TAOK1Q7L7X3 1001 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 PGBD5Q8N414 524 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 OR14L1PQ8NHC6 308 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 USP6NLQ92738 828 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 TMEM68Q96MH6 324 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP4.29□□□□□ -1.721e-8■□□□□ 10.4
RBM39-211ENST00000426951 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa4.29□□□□□ -1.72
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RBM39-211ENST00000426951 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 WNT16Q9UBV4 365 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 TINAGQ9UJW2 476 aa4.29□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 A0A0U1RQJ8 604 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 CPED1A4D0V7 1026 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 CLEC18AA5D8T8 446 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 SOCS6O14544 535 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 ZBED4O75132 1171 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 TIPRLO75663 272 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 PLA2G2AP14555 144 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 MAOAP21397 527 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 TNFRSF8P28908 595 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 MYBPHQ13203 477 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 AMZ1Q400G9 498 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 LRCH2Q5VUJ6 765 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 PDXDC1Q6P996 788 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 C9orf106Q8NAJ2 232 aa4.28□□□□□ -1.72
RBM39-211ENST00000426951 CLEC18CQ8NCF0 446 aa4.28□□□□□ -1.72
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