RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa13.19□□□□□ -0.3
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSDMCQ9BYG8 508 aa13.19□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMA2P25787 234 aa13.17□□□□□ -0.3
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNGA3Q16281 694 aa13.17□□□□□ -0.3
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa13.16□□□□□ -0.3
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNPDA1P46926 289 aa13.16□□□□□ -0.3
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERMARDQ5T6L9 678 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMCO4Q5TGY1 634 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACAD10Q6JQN1 1059 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMEPA1Q969W9 287 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAAR9Q96RI9 348 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEBP4Q96S96 227 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX101Q9BY14 249 aa13.16□□□□□ -0.3
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD5Q9NXV2 234 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEPT3Q9UH03 358 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PQ67 120 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LGALS16A8MUM7 142 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOCS5O75159 536 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPP00450 1065 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FUCA1P04066 466 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD1CP29017 333 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VIPR1P32241 457 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR3P46089 330 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIMK2P53671 638 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK3Q00526 305 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BIRC2Q13490 618 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAMLD1Q13495 774 aa13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LBRQ14739 615 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DENND2CQ68D51 928 aa13.16□□□□□ -0.3
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