RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 IMPDH1P20839 514 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNCP24863 283 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ISL1P61371 349 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LPIN1Q14693 890 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PAGE3Q5JUK9 113 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RASIP1Q5U651 963 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOC8Q8IYI6 725 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM47BQ8NA70 645 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SMYD1Q8NB12 490 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIB2Q92519 343 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP21Q9H596 190 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LTB4R2Q9NPC1 389 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PNPLA3Q9NST1 481 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 VTI1BQ9UEU0 232 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC39A10Q9ULF5 831 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IKBKGQ9Y6K9 419 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KNL1Q8NG31 2342 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 B4GAT1O43505 415 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 JCHAINP01591 159 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLV3-27P01718 113 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT2B4P06133 528 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ADCYAP1R1P41586 468 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GALK1P51570 392 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KANK2Q63ZY3 851 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF12Q96FN5 646 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MARK4Q96L34 752 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1671Q9BY89 1806 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 F5H423 210 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLCO1B7G3V0H7 640 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 M0QZQ0 153 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GRB14Q14449 540 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT81Q14533 505 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GRIK4Q16099 956 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF678Q5SXM1 525 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GBP5Q96PP8 586 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EFCAB1Q9HAE3 211 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC4Q9HBW1 653 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 VTA1Q9NP79 307 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A13Q9NSD5 602 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC11AQ9Y240 323 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GREB1Q4ZG55 1949 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NRP2O60462 931 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP11A1P05108 521 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGB1P05556 798 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 APOA4P06727 396 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM200BP0CF97 657 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GLRBP48167 497 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NRIP1P48552 1158 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DSC3Q14574 896 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DGKDQ16760 1214 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KYAT1Q16773 422 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 WSCD1Q658N2 575 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NEPROQ6NW34 567 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KLC3Q6P597 504 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IYDQ6PHW0 289 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PEX13Q92968 403 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TP53INP1Q96A56 240 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MPP4Q96JB8 637 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A23Q9BV35 468 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AKIP1Q9NQ31 210 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 VWA8A3KMH1 1905 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NPIPB8E9PQR5 432 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF623O75123 536 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GSK3BP49841 420 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4D2P58180 307 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GBX1Q14549 363 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PCID2Q5JVF3 399 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ERO1BQ86YB8 467 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GPC2Q8N158 579 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2T11Q8NH01 316 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MAML3Q96JK9 1138 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CRISPLD1Q9H336 500 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HIPK3Q9H422 1215 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MROH8Q9H579 483 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM149AA5PLN7 773 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 F8W810 466 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms