RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CASC3O15234 703 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TLR5O60602 858 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GP1BAP07359 652 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITGA2BP08514 1039 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GIMD1P0DJR0 217 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GOT1P17174 413 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAGEA6P43360 314 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GDF10P55107 478 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OXCT1P55809 520 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPS1Q13098 491 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIF26BQ2KJY2 2108 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 P3H1Q32P28 736 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HSP90B2PQ58FF3 399 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MANEAQ5SRI9 462 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNX30Q5VWJ9 437 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RFX8Q6ZV50 586 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UNC45BQ8IWX7 931 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PYROXD2Q8N2H3 581 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OVCA2Q8WZ82 227 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EDEM1Q92611 657 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM109Q9BVC6 243 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAGEB5Q9BZ81 275 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM245Q9H330 911 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MTG2Q9H4K7 406 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WDCPQ9H6R7 721 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NMUR1Q9HB89 426 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANLNQ9NQW6 1124 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DTLQ9NZJ0 730 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 U3KQA8 63 aa9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1W2PP55 124 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1W2PQH9 124 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPED1A4D0V7 1026 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C5orf60A6NFR6 353 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC72A6NJI9 287 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCNU1A8MYU2 1149 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SEMA7AO75326 666 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GCATO75600 419 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PENKP01210 267 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C7P10643 843 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ETS1P14921 441 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AMPD1P23109 780 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCR1P32246 355 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD97P48960 835 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TUBP50607 506 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POLE2P56282 527 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GBE1Q04446 702 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 E2F5Q15329 346 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARTNQ5T4W7 220 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MANEALQ5VSG8 457 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q6ZNB5 142 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM71DQ8N9W8 422 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR2T34Q8NGX1 318 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC39A13Q96H72 371 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C1orf74Q96LT6 269 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SERPINB11Q96P15 392 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BRD8Q9H0E9 1235 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TKTL2Q9H0I9 626 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OSER1Q9NX31 292 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PAK5Q9P286 719 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NUDT5Q9UKK9 219 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLA2G4CQ9UP65 541 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HEY1Q9Y5J3 304 aa9.62□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC187A0A096LP49 1063 aa9.61□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1B0GTL3 188 aa9.61□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 E7ESA3 106 aa9.61□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM72CH0Y354 149 aa9.61□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H7C0C1 242 aa9.61□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RIPK2O43353 540 aa9.61□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TIMM44O43615 452 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms