RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409289.6

RBMS1-204, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RBMS1, Length 1,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-204ENST00000409289 CASS4Q9NQ75 786 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 BFARQ9NZS9 450 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 A6NJY4 79 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SDR42E2A6NKP2 422 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 MAN2B1O00754 1011 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ALOX15BO15296 676 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 NDST3O95803 873 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 EPOP01588 193 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 EPHX1P07099 455 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PDHA1P08559 390 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 HLA-DPA1P20036 260 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PRKCHP24723 683 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SERPINA4P29622 427 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ELK3P41970 407 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 MAGEA4P43358 317 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PMS2P54278 862 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 TRAF2Q12933 501 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SLC1A5Q15758 541 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SIRPB2Q5JXA9 342 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CASC4Q6P4E1 433 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 GDPD4Q6W3E5 623 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PALM2Q8IXS6 379 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CHPFQ8IZ52 775 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 STK40Q8N2I9 435 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 FBXO36Q8NEA4 188 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CAVIN3Q969G5 261 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 FEM1CQ96JP0 617 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 C9orf72Q96LT7 481 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ADGRE3Q9BY15 652 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 IL36AQ9UHA7 158 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa8.69□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 E7ESA3 106 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 NPC1O15118 1278 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SOCS5O75159 536 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 LEFTY1O75610 366 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PGLSO95336 258 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CPP00450 1065 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PRLP01236 227 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 FGF1P05230 155 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 UGT2B4P06133 528 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 NTSR1P30989 418 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SLC8A1P32418 973 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 MAGEA3P43357 314 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 EPHB1P54762 984 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CRADDP78560 199 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 NHLH1Q02575 133 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PRKCQQ04759 706 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 KYNUQ16719 465 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CFAP58Q5T655 872 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 MPP5Q8N3R9 675 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 OR8D1Q8WZ84 308 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ANKRD7Q92527 254 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CFAP36Q96G28 342 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 TRIB3Q96RU7 358 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ARNT2Q9HBZ2 717 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PRSS16Q9NQE7 514 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SYBUQ9NX95 663 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 WNT16Q9UBV4 365 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CKAP5Q14008 2032 aa8.68□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 USP34Q70CQ2 3546 aa8.67□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 MAGEB16A2A368 324 aa8.67□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SHISA7A6NL88 538 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms