RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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ODC1-202ENST00000405333 UCMAQ8WVF2 138 aa20.16■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 SCRN2Q96FV2 425 aa20.16■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 FAM129BQ96TA1 746 aa20.16■□□□□ 0.82
ODC1-202ENST00000405333 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.16■□□□□ 0.82
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ODC1-202ENST00000405333 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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ODC1-202ENST00000405333 PTSQ03393 145 aa20.13■□□□□ 0.81
ODC1-202ENST00000405333 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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ODC1-202ENST00000405333 GPR153Q6NV75 609 aa20.13■□□□□ 0.81
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