RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 TMC5Q6UXY8 1006 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TIFABQ6ZNK6 161 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 C11orf96Q7Z7L8 435 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 AHI1Q8N157 1196 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFYVE19Q96K21 471 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 NUAK2Q9H093 628 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 AHSPQ9NZD4 102 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa16.39■□□□□ 0.22
CTDSP2-201ENST00000398073 TYMPP19971 482 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP3A5P20815 502 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CDH3P22223 829 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 GALNT3Q14435 633 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CLEC6AQ6EIG7 209 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF540Q8NDQ6 660 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 LPPQ93052 612 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MED8Q96G25 268 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 BCO2Q9BYV7 579 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A51Q9H1U9 297 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MAPRE3Q9UPY8 281 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MATN3O15232 486 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 RPP40O75818 363 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 HPCAL1P37235 193 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 IDH2P48735 452 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TSNQ15631 228 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 LUZP2Q86TE4 346 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB46Q86UZ6 589 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SYTL1Q8IYJ3 562 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TRPM4Q8TD43 1214 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 H6PDO95479 791 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 IVDP26440 423 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP2R1BP30154 601 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 RPS9P46781 194 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC9A4Q6AI14 798 aa16.39■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 DAOAP59103 153 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 STARD3Q14849 445 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PLCL1Q15111 1095 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 C11orf74Q86VG3 221 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SOCS4Q8WXH5 440 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 COQ10BQ9H8M1 238 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 KLHL20Q9Y2M5 609 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 E7ESA3 106 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 URODP06132 367 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CES1P23141 567 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 THOP1P52888 689 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 LILRA4P59901 499 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 LCP2Q13094 533 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR180Q86V85 440 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 DENND6AQ8IWF6 608 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 C19orf18Q8NEA5 215 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 DENND1AQ8TEH3 1009 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PHF21AQ96BD5 680 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CXorf21Q9HAI6 301 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 G3V2T6 193 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 GSTM1P09488 218 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 REPS1Q96D71 796 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 C22orf31O95567 290 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SERPINA4P29622 427 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 LSM3P62310 102 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 LIPEQ05469 1076 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 FRMD7Q6ZUT3 714 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM192Q8IY95 271 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CLEC4CQ8WTT0 213 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ADI1Q9BV57 179 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXW11Q9UKB1 542 aa16.38■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM149AA5PLN7 773 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 EFCAB14O75071 495 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MFN2O95140 757 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 THAP5Q7Z6K1 395 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SIGLEC10Q96LC7 697 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PPM1MQ96MI6 270 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ALG2Q9H553 416 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MSI1O43347 362 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 RPS6KA3P51812 740 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms