RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 CLDN6P56747 220 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB17Q13105 803 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 HES3Q5TGS1 186 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 NPNTQ6UXI9 565 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 PELI3Q8N2H9 469 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CNTD1Q8N815 330 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 BOCQ9BWV1 1114 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 KLQ9UEF7 1012 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CHKBQ9Y259 395 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM202A6NGA9 273 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 YY2O15391 372 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 GP1BAP07359 652 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ANXA6P08133 673 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CA4P22748 312 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 KELP23276 732 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ETV3P41162 512 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 NR2C2P49116 596 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 DYNLT1P63172 113 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 AP1B1Q10567 949 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TFDP2Q14188 446 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ELOCQ15369 112 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 DENND2CQ68D51 928 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 OR56A4Q8NGH8 313 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR26Q9H7D7 661 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 APC2O95996 2303 aa20.59■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFHX4Q86UP3 3567 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 RP1P56715 2156 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 RCCD1A6NED2 376 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TNFRSF10CO14798 259 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TNFP01375 233 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 MMP2P08253 660 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CTSEP14091 401 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF30P17039 623 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 EPHB1P54762 984 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC66Q68CR7 880 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 KCTD16Q68DU8 428 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 Q6ZVL8 140 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 PDXPQ96GD0 296 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 SMIM14Q96QK8 99 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 LGR4Q9BXB1 951 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 FGF22Q9HCT0 170 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 DKK4Q9UBT3 224 aa20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CST8O60676 142 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 TEAD1P28347 426 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CD86P42081 329 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 SKOR1P84550 965 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 PTSQ03393 145 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 DPTQ07507 201 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 DAAM2Q86T65 1068 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 PROSER1Q86XN7 944 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 LYSMD1Q96S90 227 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 TEX101Q9BY14 249 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A0U1RQS6 177 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 CAPN8A6NHC0 703 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.56■□□□□ 0.88
UBE2E3-201ENST00000392415 TAF4O00268 1085 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms