RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381223.9

ZBED1-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED1, Length 4,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-203ENST00000381223 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 PIM3Q86V86 326 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 SPPL2AQ8TCT8 520 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 ZNF558Q96NG5 402 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 CYLDQ9NQC7 956 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 HS6ST1O60243 411 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 RFPL1O75677 317 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 FBXL22Q6P050 247 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 DPPA5A6NC42 116 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 TRIM38O00635 465 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 MAF1Q9H063 256 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 INVSQ9Y283 1065 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 MYADML2A6NDP7 307 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 ULK1O75385 1050 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 PCDH8O95206 1070 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 IRF8Q02556 426 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 POMPQ9Y244 141 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 U3KQV3 271 aa14.54□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 OR6C75A6NL08 312 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 CNMDO75829 334 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 IFNA8P32881 189 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 TREML1Q86YW5 311 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 C19orf60Q96EN9 201 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 NMUR1Q9HB89 426 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 GLI3P10071 1580 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 BTAF1O14981 1849 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 TNFAIP8O95379 198 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 KCNE1P15382 129 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 GATMP50440 423 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 NOGQ13253 232 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 C14orf80Q86SX3 495 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 ADCK1Q86TW2 530 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 RDH11Q8TC12 318 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 LPGAT1Q92604 370 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 FETUBQ9UGM5 382 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 NENFQ9UMX5 172 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 NDST3O95803 873 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 S100A3P33764 101 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 RAP1GDS1P52306 607 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 ABRQ12979 859 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 IRGQQ8WZA9 623 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 BDH2Q9BUT1 245 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.081e-9■■■■■ 54.1
ZBED1-203ENST00000381223 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 RMND5AQ9H871 391 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 A0A0U1RQF3 1178 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 F8W810 466 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 RPP40O75818 363 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 GSNP06396 782 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 OR56A5P0C7T3 313 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 HNF4AP41235 474 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 ACLYP53396 1101 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 SLC18A2Q05940 514 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.53□□□□□ -0.08
ZBED1-203ENST00000381223 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms