RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ENPEPQ07075 957 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 BROXQ5VW32 411 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 HEATR4Q86WZ0 1026 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 GMIPQ9P107 970 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ISM1B1AKI9 464 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 OR6B1O95007 311 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ALOX12P18054 663 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 RFX4Q33E94 735 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 TIGD2Q4W5G0 525 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA8L1Q5VT79 327 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ENKURQ8TC29 256 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 JAM2P57087 298 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CSNK2BP67870 215 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 MAPK11Q15759 364 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 MPPE1Q53F39 396 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 COMMD2Q86X83 199 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 MOSPD2Q8NHP6 518 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB118Q96PH6 123 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 COL20A1Q9P218 1284 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 GCATO75600 419 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 L1CAMP32004 1257 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 NRP2O60462 931 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINB7O75635 380 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 FGF19O95750 216 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 AP2A1O95782 977 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 GSTM5P46439 218 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP8P85298 464 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 AMER2Q8N7J2 671 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 TCF12Q99081 682 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ACBD6Q9BR61 282 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PQ67 120 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PDE9AO76083 593 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CCNCP24863 283 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 MRC1P22897 1456 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 BBIP1A8MTZ0 92 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 GRM6O15303 877 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 OR10H2O60403 315 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CST1P01037 141 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PDK3Q15120 406 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CLN6Q9NWW5 311 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 OR10H1Q9Y4A9 318 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 HIST1H2ABP04908 130 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 OR4Q2P0C623 313 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 TLL1O43897 1013 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 MAPK10P53779 464 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 NR1H2P55055 460 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 RGS1Q08116 209 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 OR7A2PQ8NGA2 310 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 DMAC2Q9NW81 257 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 E9PAM4 449 aa20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA5AQ13591 1074 aa20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF671Q8TAW3 534 aa20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 KELP23276 732 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms