RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 SORCS1Q8WY21 1168 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 MYLIPQ8WY64 445 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 OMDQ99983 421 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 SUV39H2Q9H5I1 410 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CATSPERZQ9NTU4 200 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
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LIMS1-202ENST00000338045 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
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LIMS1-202ENST00000338045 COL4A3Q01955 1670 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TTC34A8MYJ7 566 aa15.46■□□□□ 0.06
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LIMS1-202ENST00000338045 SLC6A11P48066 632 aa15.46■□□□□ 0.06
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LIMS1-202ENST00000338045 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa15.46■□□□□ 0.06
LIMS1-202ENST00000338045 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa15.46■□□□□ 0.06
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LIMS1-202ENST00000338045 ZNF358Q9NW07 568 aa15.46■□□□□ 0.06
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LIMS1-202ENST00000338045 PKP3Q9Y446 797 aa15.46■□□□□ 0.06
LIMS1-202ENST00000338045 C5orf42Q9H799 3197 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-202ENST00000338045 A0A0U1RQS6 177 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-202ENST00000338045 PRRT4C9JH25 899 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-202ENST00000338045 BNIP3LO60238 219 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-202ENST00000338045 SLC4A1P02730 911 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-202ENST00000338045 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-202ENST00000338045 RUNX3Q13761 415 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-202ENST00000338045 COL19A1Q14993 1142 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-202ENST00000338045 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
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