RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 STC1P52823 247 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 EPHB1P54762 984 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 AP1S1P61966 158 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 KCNJ2P63252 427 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.462e-13■■□□□ 13
ACTB-201ENST00000331789 CTC1Q2NKJ3 1217 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 RALGPS1Q5JS13 557 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 C9orf50Q5SZB4 431 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 LIPMQ5VYY2 423 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 FAM45BPQ6NSW5 357 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 AFTPHQ6ULP2 937 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 TTC7BQ86TV6 843 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 FAM45AQ8TCE6 357 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 PIH1D2Q8WWB5 315 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 ING5Q8WYH8 240 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 MYO19Q96H55 970 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 FAM96AQ9H5X1 160 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 TXLNGQ9NUQ3 528 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-201ENST00000331789 TMEM114B3SHH9 223 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 FCHO1O14526 889 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 XYLBO75191 536 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 PGLSO95336 258 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 HSPA4LO95757 839 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 RB1P06400 928 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 CA3P07451 260 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 ALPIP09923 528 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
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ACTB-201ENST00000331789 CCR10P46092 362 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 GRIA4P48058 902 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 TYSND1Q2T9J0 566 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 FUT11Q495W5 492 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 ARMC12Q5T9G4 340 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 ASRGL1Q7L266 308 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 MAVSQ7Z434 540 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 KLHL29Q96CT2 875 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 UBXN10Q96LJ8 280 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 TLE6Q9H808 572 aa17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 STX7O15400 261 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 FDXRP22570 491 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 FAM83EQ2M2I3 478 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 ZNF781Q8N8C0 355 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 TMEM237Q96Q45 408 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 WWP1Q9H0M0 922 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 ARL8BQ9NVJ2 186 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
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ACTB-201ENST00000331789 SRCP12931 536 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 NQO1P15559 274 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 CEBPBP17676 345 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 MC4RP32245 332 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 CSNK1DP48730 415 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 NAGLUP54802 743 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 BCL2L1Q07817 233 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 USP4Q13107 963 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 ZNF77Q15935 545 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 TECRLQ5HYJ1 363 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 SPDYAQ5MJ70 313 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 AGAP9Q5VTM2 703 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 EID2BQ96D98 161 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 RILPQ96NA2 401 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 BBS2Q9BXC9 721 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 NMUR2Q9GZQ4 415 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 ZNF711Q9Y462 761 aa17.88■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 ZNF195O14628 629 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 ATP5HO75947 161 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 CHRNGP07510 517 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 FMO4P31512 558 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 SLC20A2Q08357 652 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 GPM6BQ13491 265 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 PEX6Q13608 980 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 PIANPQ8IYJ0 282 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 IRF7Q92985 503 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 FAM136AQ96C01 138 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 CERS4Q9HA82 394 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 SAR1AQ9NR31 198 aa17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 HACD3Q9P035 362 aa17.87■□□□□ 0.45
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