RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 FGF4P08620 206 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ARSAP15289 507 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 PTPN2P17706 415 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 TPH1P17752 444 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 PTPRAP18433 802 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 IMPDH1P20839 514 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 YWHAQP27348 245 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ADRA1BP35368 520 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ETFBP38117 255 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 SLC26A3P40879 764 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 GABARAPL2P60520 117 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 NFKB2Q00653 900 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 PRPSAP1Q14558 356 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ACAP2Q15057 778 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 CRY1Q16526 586 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 BTBD8Q5XKL5 378 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 NEPROQ6NW34 567 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 EFCAB12Q6NXP0 572 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 DENND6AQ8IWF6 608 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 LRRC58Q96CX6 371 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 C19orf60Q96EN9 201 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 RDH12Q96NR8 316 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 TSGA13Q96PP4 275 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 LHPPQ9H008 270 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 HOXC10Q9NYD6 342 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 STAP1Q9ULZ2 295 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 TSC2P49815 1807 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 COL4A5P29400 1685 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 SCN1AP35498 2009 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ANGPT2O15123 496 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 HBP1O60381 514 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 CAPN3P20807 821 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 CRHBPP24387 322 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 CHRNA5P30532 468 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 OPRL1P41146 370 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 PLA2G16P53816 162 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 GRIK2Q13002 908 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 CYP51A1Q16850 503 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ZNF618Q5T7W0 954 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 GALNT7Q86SF2 657 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 CLYBLQ8N0X4 340 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 CADM3Q8N126 398 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 MIER2Q8N344 545 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 PIK3C3Q8NEB9 887 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 BPIFB1Q8TDL5 484 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 C17orf50Q8WW18 174 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 WNT8BQ93098 351 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 TMEM125Q96AQ2 219 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 KIF12Q96FN5 646 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 LRCH3Q96II8 777 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ASB2Q96Q27 587 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 CTRCQ99895 268 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 TREX1Q9NSU2 369 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ZNF112Q9UJU3 913 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ANAPC2Q9UJX6 822 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 CITO14578 2027 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 TPST1O60507 370 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 C22orf31O95567 290 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 HPRP00739 348 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ALBP02768 609 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 CPB1P15086 417 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 TGM1P22735 817 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 HPCAL1P37235 193 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 SLC1A2P43004 574 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ALDH3A2P51648 485 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 CLCN3P51790 818 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 OCA2Q04671 838 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 CTBP1Q13363 440 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ZBTB6Q15916 424 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 PHKG1Q16816 387 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 CYP2U1Q7Z449 544 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 SPARTQ8N0X7 666 aa11.27□□□□□ -0.6
GINS3-202ENST00000328514 SPATA6LQ8N4H0 392 aa11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms