RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 H0Y8X5 98 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 ANXA9O76027 345 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 PIRTP0C851 137 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 HOXD12P35452 270 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 PI4KAP42356 2102 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 GRIA4P48058 902 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 GEMP55040 296 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 CLDN2P57739 230 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 SPARCL1Q14515 664 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 TRIM61Q5EBN2 209 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 KCTD11Q693B1 232 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 SLC23A3Q6PIS1 610 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 USP45Q70EL2 814 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 ASB12Q8WXK4 309 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 CENPTQ96BT3 561 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 LYSMD1Q96S90 227 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 HINFPQ9BQA5 517 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 CAPN10Q9HC96 672 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 RXFP3Q9NSD7 469 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 EPOP01588 193 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 ELFN1P0C7U0 828 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 OAS2P29728 719 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 RACK1P63244 317 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 PTSQ03393 145 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 SGCGQ13326 291 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 CSRP2Q16527 193 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 C8orf74Q6P047 294 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 EMBQ6PCB8 327 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 IFT20Q8IY31 132 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 EID2BQ96D98 161 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 BMFQ96LC9 184 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 COQ10AQ96MF6 247 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 APOL2Q9BQE5 337 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 FICDQ9BVA6 458 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 DNAH14Q0VDD8 3507 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 CLDN7O95471 211 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 CFIP05156 583 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 GNSP15586 552 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 DPP6P42658 865 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 SLC1A5Q15758 541 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 WSCD2Q2TBF2 565 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 LRRC66Q68CR7 880 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 DENND2CQ68D51 928 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 RANBP10Q6VN20 620 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 ATL2Q8NHH9 583 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 POM121BA6NF01 834 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC188H7C350 402 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 LRP3O75074 770 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 PHF2O75151 1096 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 USP12O75317 370 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 NUDT1P36639 197 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 PRPSAP1Q14558 356 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 PELI3Q8N2H9 469 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 CEP76Q8TAP6 659 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 SLC6A14Q9UN76 642 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1B0GVT2 93 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 AURKAO14965 403 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 C1SP09871 688 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 AGERQ15109 404 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC89Q8N998 374 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF292O60281 2723 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11B-201ENST00000328024 CD38P28907 300 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms