RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327331.2

CDCA8-201, Transcript of cell division cycle associated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDCA8, Length 2,303 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8-201ENST00000327331 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 TRABD2AQ86V40 505 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 SPNS2Q8IVW8 549 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 BBS5Q8N3I7 341 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 EFHBQ8N7U6 833 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 DCAF4L2Q8NA75 395 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 TUBB6Q9BUF5 446 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 IL22Q9GZX6 179 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 IKBKGQ9Y6K9 419 aa11.65□□□□□ -0.54
CDCA8-201ENST00000327331 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ANTXRLA6NF34 631 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 HEPACAM2A8MVW5 462 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PSMD3O43242 534 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PIGNO95427 931 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PRKCHP24723 683 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 NPY2RP49146 381 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 CDK18Q07002 472 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 NR1H3Q13133 447 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 DHCR24Q15392 516 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TMEM215Q68D42 235 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 LRRC6Q86X45 466 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SFTPA1Q8IWL2 248 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 LPCAT1Q8NF37 534 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF398Q8TD17 642 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SMARCD2Q92925 531 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 NSL1Q96IY1 281 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 LMLNQ96KR4 655 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 MYADMQ96S97 322 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ECSITQ9BQ95 431 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 KXD1Q9BQD3 176 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 MOCS1Q9NZB8 636 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SOX13Q9UN79 622 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 FAM159BA6NKW6 160 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SPAG6O75602 509 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 CR2P20023 1033 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 GMPRP36959 345 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PGGT1BP53609 377 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SEMG2Q02383 582 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TRAF2Q12933 501 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ADGRE1Q14246 886 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 CNGA3Q16281 694 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 GEN1Q17RS7 908 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 EML3Q32P44 896 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 DGKKQ5KSL6 1271 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 MPP7Q5T2T1 576 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 MROH9Q5TGP6 573 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF783Q6ZMS7 281 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 RINLQ6ZS11 566 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF366Q8N895 744 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TADA1Q96BN2 335 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 RMDN1Q96DB5 314 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 CERS2Q96G23 380 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 DHRS4Q9BTZ2 278 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TRABDQ9H4I3 376 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 MTG2Q9H4K7 406 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 RETREG1Q9H6L5 497 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TBC1D14Q9P2M4 693 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 RAI2Q9Y5P3 530 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ARL5AQ9Y689 179 aa11.64□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 AURKAO14965 403 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 VAPBO95292 243 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 POU2F2P09086 479 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TSHRP16473 764 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 FCARP24071 287 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SLC6A11P48066 632 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SLC18A1P54219 525 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PCID2Q5JVF3 399 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PKN3Q6P5Z2 889 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 TMEM135Q86UB9 458 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 BPIFB1Q8TDL5 484 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 MPP4Q96JB8 637 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 SERAC1Q96JX3 654 aa11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CDCA8-201ENST00000327331 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms