RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 BBS5Q8N3I7 341 aa21.53■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 CLPTM1LQ96KA5 538 aa21.53■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.53■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 VILLO15195 856 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 URODP06132 367 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 SERPINA6P08185 405 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 COL6A2P12110 1019 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 RGRP47804 291 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 ADARP55265 1226 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 POU4F1Q01851 419 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 FBXO27Q8NI29 283 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 RDH11Q8TC12 318 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 OLFM1Q99784 485 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 SEPT3Q9UH03 358 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 TMEM114B3SHH9 223 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 CBX4O00257 560 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 FGF1P05230 155 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 HLA-DPA1P20036 260 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 IDH3AP50213 366 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 CILP2Q8IUL8 1156 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 TTC16Q8NEE8 873 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 STYXQ8WUJ0 223 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 MGME1Q9BQP7 344 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
MESP1-201ENST00000300057 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 KLHL2O95198 593 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CHRNGP07510 517 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CLTBP09497 229 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CCR10P46092 362 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 GRIA4P48058 902 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ARHGAP8P85298 464 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 KDSRQ06136 332 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ADGRF1Q5T601 910 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 LIPMQ5VYY2 423 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ZNF554Q86TJ5 538 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 GPR78Q96P69 363 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 BTBD9Q96Q07 612 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CCDC106Q9BWC9 280 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 DNAJC28Q9NX36 388 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SLC7A4O43246 635 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 KDELR3O43731 214 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CA8P35219 290 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 UGT2A3Q6UWM9 527 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 HEXDCQ8WVB3 486 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SGF29Q96ES7 293 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TBATAQ96M53 351 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CDH19Q9H159 772 aa21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 A0A087X1B8 175 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 A0A1B0GVM2 712 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TCAF2A6NFQ2 919 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ZNF195O14628 629 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ITGB8P26012 769 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ERFP50548 548 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CSHL1Q14406 222 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 NSMCE3Q96MG7 304 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 MUC3BQ9H195 1237 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SPG21Q9NZD8 308 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ILVBLA1L0T0 632 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CSF2RAP15509 400 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 MPSTP25325 297 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 CLCN5P51795 746 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 NAGLUP54802 743 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 RAB33AQ14088 237 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ALG1LQ6GMV1 187 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 OR13C4Q8NGS5 318 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 PSKH2Q96QS6 385 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 SLC22A12Q96S37 553 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 FAM96AQ9H5X1 160 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TMEM165Q9HC07 324 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.5■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa21.49■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.49■■□□□ 1.03
MESP1-201ENST00000300057 TARM1B6A8C7 271 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms