RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295927.3

PTX3-201, Transcript of pentraxin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX3, Length 1,940 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3-201ENST00000295927 PLIN3O60664 434 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 NNMTP40261 264 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 SLC6A11P48066 632 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 TAS2R39P59534 338 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 RAB10P61026 200 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 IRX4P78413 519 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 RAD51Q06609 339 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 CES5AQ6NT32 575 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 OR2A12Q8NGT7 310 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 FRS2Q8WU20 508 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 EID2BQ96D98 161 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 ECHDC3Q96DC8 303 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 NDNQ99608 321 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 OMDQ99983 421 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 IL17CQ9P0M4 197 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 FKBPLQ9UIM3 349 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 TTC34A8MYJ7 566 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 PRSS56P0CW18 603 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 STMN1P16949 149 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 CCDC63Q8NA47 563 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 ASLP04424 464 aa22.85■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 SLC35E2BP0CK96 405 aa22.85■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 HNF1BP35680 557 aa22.85■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 MESP2Q0VG99 397 aa22.85■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 ZNF460Q14592 562 aa22.85■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 PTPRNQ16849 979 aa22.85■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.85■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 WASH3PC4AMC7 463 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 TBX10O75333 385 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 BPGMP07738 259 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 HMGCLP35914 325 aa22.84■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 E2F7Q96AV8 911 aa22.84■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.84■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 H7C0S8 307 aa22.84■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 STC1P52823 247 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 SLC12A2P55011 1212 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 PEX6Q13608 980 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 CDKN3Q16667 212 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 CGB2Q6NT52 195 aa22.84■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 DEC1Q9P2X7 70 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 ACOT9Q9Y305 439 aa22.84■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 PMLP29590 882 aa22.83■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 CCDC153Q494R4 210 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 HECTD2Q5U5R9 776 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.83■■□□□ 1.25
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PTX3-201ENST00000295927 TNS4Q8IZW8 715 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 NXPE3Q969Y0 559 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTX3-201ENST00000295927 PRRT4C9JH25 899 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX3-201ENST00000295927 EBAG9O00559 213 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX3-201ENST00000295927 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTX3-201ENST00000295927 GDPD4Q6W3E5 623 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX3-201ENST00000295927 YAF2Q8IY57 180 aa22.82■■□□□ 1.24
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