RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 USP17L20D6RJB6 530 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PRSS44E7EML9 344 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PRKD3O94806 890 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TRIM16O95361 564 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PIGNO95427 931 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 WDPCPO95876 746 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 INHBAP08476 426 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 FGFR3P22607 806 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CASP4P49662 377 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 NT5C2P49902 561 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF45Q02386 682 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 USP17L24Q0WX57 530 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 C4orf46Q504U0 113 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ALFQ53S48 1182 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 GARNL3Q5VVW2 1013 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 YIPF6Q96EC8 236 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 FBXL20Q96IG2 436 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 MBOAT7Q96N66 472 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 DEFB129Q9H1M3 183 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 NIPAL2Q9H841 368 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TLR9Q9NR96 1032 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 SNX15Q9NRS6 342 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 EMC3Q9P0I2 261 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 EMCNQ9ULC0 261 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 NRXN2Q9P2S2 1712 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 H0Y626 953 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 AIM2O14862 343 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 DFNA5O60443 496 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PLA2G4BP0C869 781 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CYP11B1P15538 503 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CD1EP15812 388 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 NPR3P17342 541 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 GGT5P36269 586 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ACOT2P49753 483 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 MAPK10P53779 464 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 NAPAP54920 295 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC12A2P55011 1212 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PKNOX1P55347 436 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TGFB2P61812 414 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 FMO1Q01740 532 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 GALEQ14376 348 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 KRT79Q5XKE5 535 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CCDC103Q8IW40 242 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM71AQ8IYT1 594 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ATAD1Q8NBU5 361 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 MCUQ8NE86 351 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 OR7A2PQ8NGA2 310 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PROX1Q92786 737 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 FBXW5Q969U6 566 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CPXM1Q96SM3 734 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 MMP27Q9H306 513 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TINAGQ9UJW2 476 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 HMX2A2RU54 273 aa7.38□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 AXIN1O15169 862 aa7.38□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ST8SIA5O15466 376 aa7.38□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 GRIN3BO60391 1043 aa7.38□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM191BP0C7N4 346 aa7.38□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 SYN1P17600 705 aa7.38□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 DNAJB1P25685 340 aa7.38□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 FAPQ12884 760 aa7.38□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 KCNC3Q14003 757 aa7.38□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PDK2Q15119 407 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms