RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGVQ9NUD9 493 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D14Q9P2M4 693 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 TLR6Q9Y2C9 796 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MIA3Q5JRA6 1907 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM114B3SHH9 223 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 RALBP11234 206 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MTTPP55157 894 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 STARD6P59095 220 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MMEL1Q495T6 779 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 KBTBD6Q86V97 674 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NT5C3BQ969T7 300 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 I6L893 689 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF195O14628 629 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM24O15164 1050 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A2O15244 555 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 OPHN1O60890 802 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGA2BP08514 1039 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SULT1E1P49888 294 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 CHN2P52757 468 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 LSAMPQ13449 338 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 GRTP1Q5TC63 336 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NAT16Q8N8M0 369 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 CATSPER1Q8NEC5 780 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINI1Q99574 410 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SPHK2Q9NRA0 654 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 TXNDC16Q9P2K2 825 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NFATC1O95644 943 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGAXP20702 1163 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A11P48066 632 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SFT2D3Q587I9 215 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NADSYN1Q6IA69 706 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 HTR3CQ8WXA8 447 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 CPNE1Q99829 537 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM62Q9BVG3 475 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MFSD1Q9H3U5 465 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO15AQ9UKN7 3530 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 DENRO43583 198 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN3O60637 253 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A4P31645 630 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SGSHP51688 502 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 HDAC4P56524 1084 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP7Q14244 749 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 PON2Q15165 354 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 CA9Q16790 459 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ANO4Q32M45 955 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
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CAPNS1-201ENST00000246533 CPA6Q8N4T0 437 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM3CQ92520 227 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNA4P22459 653 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 GP5P40197 560 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 EPHB1P54762 984 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKCQQ04759 706 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 UBXN2BQ14CS0 331 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SPANXN3Q5MJ09 141 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf46Q6P387 395 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MAVSQ7Z434 540 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf107Q8IVU9 208 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB107AQ8IZN7 70 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF687Q8N1G0 1237 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MID2Q9UJV3 735 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS28Q9UK41 221 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 KANSL1LA0AUZ9 987 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP9BO43861 1147 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR37L1O60883 481 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 COX4I1P13073 169 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 CPA3P15088 417 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 GLULP15104 373 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINB6P35237 376 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 OPRD1P41143 372 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEA12P43365 314 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 GBE1Q04446 702 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 RING1Q06587 406 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 FZD5Q13467 585 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 PDK3Q15120 406 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A52Q3SY17 297 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP1Q6P2D0 407 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 CASC4Q6P4E1 433 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 EPGNQ6UW88 154 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MARVELD2Q8N4S9 558 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NAT14Q8WUY8 206 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC4EQ9ULY5 219 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMD13Q9UNM6 376 aa26.4■■□□□ 1.82
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