RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229384.5

GATC-201, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C, humanhuman

TSL 2

Gene GATC, Length 372 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATC-201ENST00000229384 TSGA13Q96PP4 275 aa14.91□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 CHP1Q99653 195 aa14.91□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 SEMA3CQ99985 751 aa14.91□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 ZNF670Q9BS34 389 aa14.91□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 TEX101Q9BY14 249 aa14.91□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.91□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.91□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 NT5MQ9NPB1 228 aa14.91□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.91□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.91□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 GULP1Q9UBP9 304 aa14.91□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 GPR34Q9UPC5 381 aa14.91□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 A0A1W2PQM1 296 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 NOBOXO60393 691 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 SOD1P00441 154 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 PRLP01236 227 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 TMEM253P0C7T8 217 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 CTPS1P17812 591 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 CCNCP24863 283 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 MAN1A1P33908 653 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 GJC1P36383 396 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 ETV3P41162 512 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 DSC2Q02487 901 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 GBE1Q04446 702 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 PDK2Q15119 407 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 Q6ZVL8 140 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 RAPGEF5Q92565 580 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 CCDC74AQ96AQ1 378 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 NUS1Q96E22 293 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 SATB2Q9UPW6 733 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 ST14Q9Y5Y6 855 aa14.9□□□□□ -0.02
GATC-201ENST00000229384 BPTFQ12830 3046 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 MATN3O15232 486 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 CEACAM5P06731 702 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 PTMSP20962 102 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 CCL7P80098 99 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 SKOR1P84550 965 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 TLE3Q04726 772 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 NRROSQ86YC3 692 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 VSTM4Q8IW00 320 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 BBS5Q8N3I7 341 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 KCTD6Q8NC69 237 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 WDR26Q9H7D7 661 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 CYP4F12Q9HCS2 524 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.89□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 PRSS38A1L453 326 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 CDRT15L2A8MXV6 281 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 PSMD11O00231 422 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 HLA-DQB2P05538 268 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 KDELR1P24390 212 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 TEAD1P28347 426 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 CDK3Q00526 305 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 PTSQ03393 145 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 DPTQ07507 201 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 DENND2CQ68D51 928 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 LSMEM2Q8N112 164 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 PAF1Q8N7H5 531 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 WDR48Q8TAF3 677 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 HDAC11Q96DB2 347 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 RNF157Q96PX1 679 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 ABCG8Q9H221 673 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.88□□□□□ -0.03
GATC-201ENST00000229384 DTLQ9NZJ0 730 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms