RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006777.10

RHBDD2-201, Transcript of rhomboid domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHBDD2, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2-201ENST00000006777 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 G3V2L1 256 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 PFDN6O15212 129 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 DCTN3O75935 186 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 PIGNO95427 931 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC26A3P40879 764 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 PRKAA2P54646 552 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF460Q14592 562 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 CES4AQ5XG92 561 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 SCYL1Q96KG9 808 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 OLFM1Q99784 485 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 PKP3Q9Y446 797 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC4A1P02730 911 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 MYL2P10916 166 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 HMGCLP35914 325 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 SEMA3AQ14563 771 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 MYLK3Q32MK0 819 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ZYG11AQ6WRX3 759 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ADIPOR2Q86V24 386 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 PAF1Q8N7H5 531 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 GPR78Q96P69 363 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 GPR63Q9BZJ6 419 aa21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 A0A0J9YYE9 177 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 TRBC1P01850 177 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC1A6P48664 564 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 RAD51Q06609 339 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 SETDB1Q15047 1291 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 DHCR24Q15392 516 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM83EQ2M2I3 478 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 AGAP9Q5VTM2 703 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 OR6Y1Q8NGX8 325 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 PPP2R3CQ969Q6 453 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 NXNL1Q96CM4 212 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 POPDC3Q9HBV1 291 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 GPAMQ9HCL2 828 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 IL17CQ9P0M4 197 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 FKBPLQ9UIM3 349 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 DCTN4Q9UJW0 460 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 CRYL1Q9Y2S2 319 aa21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ANKRD65E5RJM6 399 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 TRIM13O60858 407 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 DLDP09622 509 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 MC4RP32245 332 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ARFIP2P53365 341 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 PGGT1BP53609 377 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ITGA9Q13797 1035 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 CARD16Q5EG05 197 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 PLPP6Q8IY26 295 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 TMEM151AQ8N4L1 468 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 OXSMQ9NWU1 459 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 FBXO10Q9UK96 956 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 POP4O95707 220 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ADH1CP00326 375 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 CTPS1P17812 591 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 FDXRP22570 491 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 FSHRP23945 695 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 TTPAP49638 278 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 DLG1Q12959 904 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ACCSLQ4AC99 568 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 KLC3Q6P597 504 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 FITM2Q8N6M3 262 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 PPP4R1Q8TF05 950 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 SIKE1Q9BRV8 207 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC28A3Q9HAS3 691 aa21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 A0A0G2JND7 137 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 A0A1W2PQ67 120 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 CAPN8A6NHC0 703 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 TMEM114B3SHH9 223 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 TARM1B6A8C7 271 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 TK2O00142 265 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 NDUFS3O75489 264 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 CYP17A1P05093 508 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ALPIP09923 528 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ADH5P11766 374 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 GKP32189 559 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 GLRBP48167 497 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 SUOXP51687 545 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 CDKN2DP55273 166 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms