RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	LAMA5	O15230	3695 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRC53	A6NM62	1247 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599		J3QKU1	62 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	MYBL1	P10243	752 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	MIP	P30301	263 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC5A2	P31639	672 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CCKBR	P32239	447 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SERPINB6	P35237	376 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	RGR	P47804	291 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PDX1	P52945	283 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CLN3	Q13286	438 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	LY6D	Q14210	128 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CA9	Q16790	459 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	USP53	Q70EK8	1073 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR156	Q8NFN8	814 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	VOPP1	Q96AW1	172 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF599	Q96NL3	588 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	FGF22	Q9HCT0	170 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	MYLK	Q15746	1914 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PRSS38	A1L453	326 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM202	A6NGA9	273 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SOCS5	O75159	536 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP1A3	P13637	1013 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	HGF	P14210	728 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PNLIP	P16233	465 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	VIPR1	P32241	457 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	MAPK10	P53779	464 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	RALGDS	Q12967	914 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	MANEA	Q5SRI9	462 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PNCK	Q6P2M8	343 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	USP45	Q70EL2	814 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	HSPH1	Q92598	858 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PSKH2	Q96QS6	385 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PEBP4	Q96S96	227 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	APPL1	Q9UKG1	709 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1W2PQM1	296 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	LIPC	P11150	499 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	GZMA	P12544	262 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	HCAR3	P49019	387 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SKOR1	P84550	965 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	TYRO3	Q06418	890 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	KRT81	Q14533	505 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	AMZ1	Q400G9	498 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	AFMID	Q63HM1	303 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SPRED1	Q7Z699	444 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PIM3	Q86V86	326 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	NPW	Q8N729	165 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	MED8	Q96G25	268 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		14.71	□□□□□ -0.05

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